Jueves 25 de febrero del 2010

El día de hoy jueves 25 d febrero del 2010 se inicio con la introducción al nuevo tema “enzimas”.

Las enzimas son moléculas que sirven como catalizadores biológicos.

Un catalizador es aquella sustancia que mejora el rendimiento de una reacción química.

Existen dos tipos de catalizadores:

- Catalizador positivo: catalizadores que aceleran las reacciones.

- Catalizador negativo o inhibidor: catalizadores que disminuyen la velocidad de reacción.

También existen moléculas conocidas como moléculas promotores que ayudan a la enzima a realizar su función tanto como catalizador positivo o inhibidor.

En contraste con lo anterior también existen moléculas conocidas como venenos catalíticos, las cuales estropean las reacciones de las enzimas. Un ejemplo de esto es en una reacción química del metino el cual mediante una reacción química se convertirá en eteno, para finalizar en propano; pero al intervenir el paladio (promotor veneno catalítico)su reacción química se detendrá en eteno.

En el caso de las enzimas la desnaturalización es irreversible.

Luis Monzon

Miercoles 24 de febrero del 2010

Bueno para en resumen de la clase del dia 24 de febrero comenzamos como todas las clases con el paso de lista y eligiendo quien iba a tener la lista de participaciones.

Una vez pasado esto comenzamos con la clase todavia seguimos hablando de proteinas pero ahora hablamos de la estructura de las proteinas.

Para definir la estructura de una proteina debemos de ver las propiedades espaciales de la secuencia de los aminocidos que la componen y de cómo interactuan entre ellos.

El primer nivel de estructuracion de las proteinas es la estructura primario.

La estructura primaria es simplemente la cadena de aminoacidos en sucuencia. Esta secuencia de aminoacidos estan unidos por enlaces covalente.

La siguiente es la estructura secundaria. La estabilidad de esta estructura la dan los puentes de hidrogeno entre los enlaces peptidicos de los aminoacidos. Esta estuctura es solamente un acomodo repetitivo de unos cuantos aminoacidos.

Existen dos tipos de estructuras secundarias:

• Helice alfa (α ): para la helice α interactuan el grupo amino del aminoacido y el grupo carbixilo de otro pero esta interaccion solo se da cada cuatro aminoacidos. Esta estructura tiene forma helicoidal o como forma de resorte.
• Hoja beta: esta tiene forma de hoja de papel en forma de acordeon. Esta estructura tambien de une por puentes de Hidrogeno. Son muy estables. Las cadena de esta corren paralelamente cuando van al mismo lado y antiparalelas cuando van en sentido contrario.

La estructura terciaria: es la forma tridimensional de una molecula. La tridimensionalidad se le da por la cantidad de dominios alfa o beta que contenga. Hay diferentes factores que propician el acomodo de la proteina. Uno de los factores son los puentes de disulfuro. Los puentes de disulfuro solo se dan en los aminoacidos que tiene Azufre y uno de los aminoacidos que contiene azufre es la Cisteina asi que los puentes de disulfuro solo se da entre la Cisteina.

Otra caracteristica que influye es la hidrofobia que tengan los aminoacidos.

El ultimo factor es la polaridad de las moleculas. Las moleculas polares tratan de acercarse al agua para estar bien, pero si tienen un radical hidrosoluble estes no funcionara y se quebrara.

La ultima estructura es la estructura cuaternaria.

La estructura cuaternaria es la conjugacion de de varias estructuras terciarias, estas pueden ser iguales o diferentes, estas estructuras asociadas forman un multimero que tiene propiedades diferentes en cada uno de sus componentes, ademas esta estructura tambien esta unida por puentes de disulfuro.

La desnaturalizacion de uan proteina es cuando de tener una estructura terciaria pierde su estructura original y se ocasiona un cambio en su propiedades.

Diana Nava

Martes 23 de febrero del 2010

Hoy comenzamos la clase viendo aminoácidos, y recordamos que un aminoácido es aquella molécula formada por un grupo amino (NH₂) y un grupo carboxilo (COOH). Los aminoácidos tienen H+ en su estructura y por ello son susceptibles a cambios en el pH (el H+ determina que tan acido o alcalino es un compuesto).

Todos los aminoácidos tienen un valor muy especifico de pH, por ello si conocemos el valor de pH de un aminoácidos sabremos de cual estamos hablando. El maestro nos puso un cuadro graficando los valores de pH que puede tener el hidróxido de sodio. El NaOH al tener valor de 1 en pH (pH bajo) es acido y se encuentra en forma catiónica (positivamente), al tener valor de 7 pH esta en su punto isoeléctrico. El valor del pH en que todas las moléculas de un aminoácido se encuentran en zwitterion se le llama punto isoeléctrico (PI). Al tener valor de 14 pH se encuentra en su forma totalmente aniónica (pH alto) es básico y se encuentra en forma negativa.

El hidróxido de sodio es una base fuerte. La curva de titulación se utiliza para saber de que aminoácido se trata y se realiza por medio de un diagrama representando la variación del pH (el cuadro que el maestro explicó en el pizarrón).

El PK (potencial de ionización), es el valor del pH en el cual la mitad de las moléculas se encuentran en forma ionizada y la otra mitad se encuentran en forma zwitterion. El punto intermedio de un aminoácido entre su pH catiónico y su punto isoeléctrico se le denomina PK¹ (PK acido), porque tiene la mitad de moléculas cargadas positivamente y la otra mitad esta en zwitterion. Y el punto intermedio del aminoácido entre su punto isoeléctrico y su pH aniónico se le llama PK² (PK base) ya que la mitad de sus moléculas son negativas y la otra mitad están en zwitterion. Un aminoácido siempre estará cerca de ser neutro cuando esta en zwitterion. Cada aminoácido tiene 2 PK.

Ya comprendido el tema, seguimos con las proteínas y péptidos. Los péptidos son cadenas de aminoácidos cortas, y se dividen enoligopéptidos y polipéptidos. Los oligopéptidos son aquellos cuyo tamaño consta de 2 a 10 aminoácidos. Los polipéptidos son aquellos que su tamaño oscila entre los 10 y 100 aminoácidos. Una proteína esta formada por más de 100 aminoácidos. El maestro puso en el pizarrón dos proteínas unidas por enlace peptídico. Un enlace peptídico es un enlace covalente entre el grupo amino de un aminoácido y el grupo carboxilo de otro aminoácido. Un extremo de esta nueva proteína debe tener C-Terminal (extremo carboxilo) y el otro extremo debe ser N- Terminal (extremo amino). Los péptidos también son anfóteros (puede reaccionar como acido o base), así como los aminoácidos y proteínas.

Para separar un péptido es necesario tener mucha agua y muchos H+ y así poder romper los enlaces. La hidrólisis es romper enlaces por medio de agua, usando como disolvente el agua.

Es muy importante la secuencia de las proteínas, ya que si una cambia podría tener graves consecuencias en la formación del feto (por dar un ejemplo). El maestro nos explicó que a las mujeres embarazadas no se les saca radiografías por no dañar al feto, ya que es tan pequeño que las radiaciones podrían afectarlo de algún modo. Nos explicaba que la anemia falciforme se da por la variación de tan solo una letra en los nucleótidos y afecta totalmente a la hemoglobina (proteína que forma parte de los glóbulos rojos) todo esto provoca que los eritrocitos se degeneren y los niños nazcan con esta patología. La anemia falciforme provoca hinchazón y dolor en las extremidades.

Las proteínas en cuanto a su composición química se dividen en: proteínas simples y proteínas conjugadas. Las proteínas simples son aquellas que están compuestas solamente por aminoácidos. Las proteínas conjugadas son aquellas que además de tener aminoácidos tienen un grupo prostético (es un componente que no es aminoácido y se haya unido a la molécula así como los aminoácidos pero en menor cantidad).

Las proteínas según su forma se dividen en: fibrosas, globulares y mixtas.

Las fibrosas son aquellas que están dispuestas en forma lineal y que son hidrofóbicas (insolubles en agua). Ejemplos: miosina, actina, queratina y colágeno.

Las globulares son de estructura cerrada lo que les permite encerrar a sus radicales y así poder ser hidrófilas o hidrosolubles. Ejemplo: hormonas y anticuerpos.

Las mixtas son aquellas que tienen regiones lineales y cerradas. De este tipo de proteínas no vimos ejemplos, pero el maestro dijo que investigaría algunos para comprender mejor este tipo de proteína.

Algunas de las funciones de las proteínas son:

· Enzimas: actúan como catalizadores del organismo.

· Hormonas: realizan funciones como intervenir en la comunicación celular y realizan diversas funciones reguladoras del organismo.

· Transporte: la hemoglobina.

· Inmunologia: Detienen a bacterias defendiendo al organismo.

· Receptores: Receptores de membrana para abrir o cerrar canales.

· Contráctiles: la actina y la miosina son proteínas que permiten el movimiento de las células.

· Conectivo: apoyo mecánico, para soportar los tejidos de alrededor.

Ceila Alva

Miercoles 17 de febrero del 2010

Hoy comenzamos ya con los temas que vienen enlistados en el temario de nuestra materia, Biomoleculas.
Las biomoleculas son partes fundamentales de los seres vivos y del ser humano en especial, existen diversos grupos fundamentales que son cuatro: Proteinas, Carbohidratos, Lipidos y Acidos nucleicos.

En este caso empezamos con proteinas.
Las proteinas estan compuestas por polimeros llamados aminoacidos. Este nombre se les da por que todos los aminoacidos, estan compuestos por un carbono quiral o asimetrico, que tienen siempre un grupo Amino y otro grupo Carboxilo (que son acidos orgánicos), de ahi es su nombre. Y su nomenclatura es mas comun en el sistema L Y D, comunmente los aminoacidos son nombrados con L, son levogiros.
Todos los aminoacidos tienen en comun una formula general, que es la siguiente:

H
NH2-C-COOH
R

El radical es el que va a cambiar en cada aminoacido y es el que le dara las caracteristicas fisicas y propiedades quimicas asi como sus funciones. Existen 20 aminoacidos principales, que son los mas comunes en la formacion de proteinas, Serina (Ser,S), Treonina (Thr,T), Cisteína (Cys,C), Asparagina (Asn,N), Glutamina (Gln,Q) y Tirosina (Tyr,Y), Glicina (Gly,G), Alanina (Ala,A), Valina (Val,V), Leucina (Leu,L), Isoleucina (Ile,I), Metionina (Met,M), Prolina (Pro,P), Fenilalanina (Phe,F) y Triptófano (Trp,W), Ácido aspártico (Asp,D) y Ácido glutámico (Glu,E), Lisina (Lys,K), Arginina (Arg,R) e Histidina (His,H).
Sin embargo existen 8 aminoacidos esenciales para el ser humano que no produce el cuerpo y que los tenemos que obtener de los alimentos ingeridos, y estos son : Valina (Val,V), Leucina (Leu,L), Isoleucina (Ile,I), Metionina (Met,M), Lisina (Lys,K), Fenilalanina (Phe,F) y Triptófano (Trp,W).

Los aminoacidos pueden presentarse en tres maneras, dependiendo del pH que contengan segun su carga sea positiva o carga negativa. La forma cationica es aquella en la que se tiene carga positiva por que contiene dos hidrogenos, uno en el grupo amino y el otro en el carboxilo, teniendo un pH bajo. La forma anionica es aquella en la que faltan estos dos hidrogenos, por lo que no estan completos los grupos quedando con carga negativa y con un pH alto.
Existe una tercera forma que se denomina Zwilterion, en la que la posicion del hidrogeno puede estar en el grupo amino o en el carboxilo o puede cambiar de posicion.

Los aminoacidos se pueden clasificar en alifaticos, aromaticos, cargados positivamente y los polares sin carga. Despues de estar comentando esta informacion realizamos una actividad y fue todo.

Adriana Hurtado

Jueves 11 de febrero del 2010

Dentro de los conceptos básicos de la termodinámica hoy en la clase de bioquímica se hablo sobre dos conceptos más aparte de la entropía. Estos fueron la entalpia y Energía libre de Gibbs.

La entalpia: Es una unidad de medida a modo de reacción química donde influye el calor y el contenido calórico que un objeto tiene.

Energía libre de Gibbs: Es la energía disponible que un objeto tiene para ejercer un trabajo dentro de la energía libre de Gibbs se vio que se divide en dos:

Exotérmica: es decir que expulsa o genera calor. -∆H

Endotérmica: Donde se gana calor o se introduce calor a un objeto. +∆H

Donde ∆ (delta) = cambio o diferencia

H= Cambio de calor

En los objetos no toda la energía que poseen es libre e utilizable, se puso el ejemplo de una galleta que contiene 3000 calorías (valor ficticio) la cual cuenta con 2000 calorías libres para realizar un trabajo.

Si dicha galleta entra al cuerpo humano, esté mediante la reacción química que incluye la ingesta tomara la energía libre que la galleta tiene. Esta reacción es exergonica y para absorber los nutrientes de dicha galleta se genera otra reacción que es la endergonica. Porque:

Exergonica: es una reacción química se gasta la energía libre de un objeto.

Edergonica: Donde se adquiere energía. ( en este caso mediante la ingesta de nutrientes)

Alina Ruiz

Miercoles 10 de febrero del 2010

Martes 9 de febrero del 2010

En esta clase vimos lo que era la isomería y los tipos de isómeros que hay.

La isomería son moléculas con la misma forma molecular (configuración) pero distinta estructura (conformación).

Los isómeros pueden ser geométricos o estereoisomeros ópticos.

Los isómeros geométricos se dividen en Cis (del mismo lado) y Trans (del otro lado), este tipo de isómeros se caracterizan por tener dobles enlaces, son mas rígidos, planos y no giran alrededor del doble enlace, por lo tanto, utilizan sustituyentes como “X” o “Y” y la posición de estos sustituyentes son las que le dan el nombre de Cis o Trans.

Los estereoisomeros ópticos su característica es que la luz polarizada gira hacia la derecha o la izquierda. Se dividen en enantiomeros y diasteroisomeros.

Los enantiomeros tienen un solo carbón quiral, imagen especular y no son superponibles.

Quiral: carbono con 4 sustituyentes distintos.

Hay 3 sistemas para darles nombre a los enantiomeros:

1) +, - : desvían la luz hacia la izquierda o la derecha.

2) L, D: si los pones en una solución y gira a la derecha es levógira y si gira a la izquierda es dextrógira.

3) R, S: si gira en sentido de las manecillas del reloj será R (Rictus) y si gira en sentido contrario será S (Sinister). Este sistema presenta una lista de importancia de sus componentes:

1.- OCH2 5-. CHO

2-. OH 6-. CH2OH

3-. NH2 7-. CH3

4-. COOH 8-. H

Los disteroisomeros no tienen imagen especular y tienen mínimo 2 carbonos quirales.

Hasta ahí terminamos el tema de isometría y vimos una introducción a otro tema nuevo el cual era TERMODINAMICA.

Termodinámica: como el calor es energía en transito, la termodinámica es una rama de la física que estudia la circulación de la energía y la relación entre la energía y el movimiento.

Energía: es la capacidad de realizar un trabajo.

Calor: es la trasferencia de energía.

Temperatura: es la medición de la vibración de las moléculas.

También miramos que el sistema termodinámico es cualquier frontera delimitada en el cual también hay materia y energía. Después se menciono que la materia al ser acelerada a la velocidad de la luz se convierte en energía.

El sistema termodinámico se basa en 4 principios

1) Primer principio de la termodinámica.

2) Segundo principio de la termodinámica.

3) Tercer principio de la termodinámica.

4) Principio cero de la termodinámica.

Posteriormente vimos una parte de un video donde nos daban una introducción sobre los 4 principios de la termodinámica; en este video mencionan que:

a) El principio cero de la termodinámica dice que la temperatura tiene sentido.

b) El primer principio es la conservación de la energía

c) El segundo principio es el de la entropía.

d) El tercer principio dice que cuando hay una temperatura muy baja nunca se puede alcanzar.

También en el video se menciono que la existencia de una maquina de depende de que una de sus partes este funcionando a una temperatura mas alta que la otra.

Lydia Ponce

Jueves 4 de febrero del 2010

Hoy comenzamos haciendo un ejericio, con una hoja de papel, que el maestro nos trajo, en ella venia un dibujo impreso, que tenia forma de una figura prismica o piramidal, ya que todos mis compañeros y yo teniamos una copia. Nos dieron la siguientes instruciones.

Primero comenzamos con recortar la figura de la copia, al pricipio fue lento por que no todos teniamos tijeras, pero despues algunos lo hicieron mediante dobleses en el papel.

Segundo, al tener la figura recortada, esta constaba de varias lineas continuas y lineas puntadas, el paso numero dos era doblar la figura por las lineas punteadas hacia adentro y las lineas continuas hacia afuera. Tambien en este paso nos tardamos un poco, debido a que no todas habiamos hecho trabajos con papel en alguna ocasion.

Tercero, al final teniamos que unir las puntas y asi formar una especie de triangulo.
Cuando la mayoria de mis compañeros terminamos e hicimos la figura, el maestro nos explico que esta era una molecula de metano representado en su forma tridimesional, siendo el carbono el punto o centro y las puntas los cuatro hidrogenos, a lo cual me sorprendi por que me parecio una manera facil y divertida de representarlo y de que nos explicara, creo que ya no se me olvidara.

Creo que al final el grupo se divirtio y ademas aprendio algo, asi que la clase me parecio muy dinamica. Eso termino el ejercicio y nos dejaron tarea sobre isomeros. Es todo.

Adriana Hurtado

Miercoles 3 de febrero del 2010

Hola

Bueno para comenzar el resumen de la clase del día 3 de febrero; al llegar al salón de clase el maestro comenzó con pasar lista, terminando el paso de lista prosiguió a explicarnos el tema que tomaríamos primero el de el uso de la información nos comento un caso de una cadena de correos de el restaurante de comida rápida Carl’s Junior de el caso de un niño que tenia sida por comer una hamburguesa cuya carne estaba contaminada con sangre de un empleado que dio positivo a la prueba de VIH, nos enseño a pensar lógicamente y a razonar cada uno de los elementos de la cadena, lo primero nos que vimos fue la estructura del virus del VIH y deducimos que al no tener organelos ni reacciones químicas este virus no esta vivo, luego vimos todos lo elementos descritos en el correo y razonamos que el virus no puede contagiarse por medio de la sangre que caiga en algún alimento, primero porque el VIH es un virus muy que no soporta el cambio de temperatura, al cambio de PH así que fuera del cuerpo no sobrevive mucho tiempo.

Luego de haber visto como no toda la información que vemos en Internet es cierta pasamos a realizar otro trabajo, en este lo que hicimos fue agruparnos en equipo de tres personas, el maestro nos dio tres elementos que eran virus, roca y perro. Nuestro trabajo era en equipo discutir y dar razones de porque eso estaba vivo o no, para eso se nos dio un tiempo de 9 minutos, una vez transcurrido el tiempo, el profesor nos pidió que dos equipos se juntaran haciendo un equipo de 6 personas, a cada equipo nos repartió uno de los tres elementos y lo que teníamos que hacer era que sin palabras expresar nuestros argumentos del porque ese elemento estaba vivo o no. El primer equipo que paso nos explico por medio de dibujos que el perro estaba vivo primero porque estaba compuesto de células que son las unidades fundamentales para la vida, luego se nos mostró que el perro tiene órganos que tienen una función y en conjunto los órganos forman sistemas que funcionan para mantener la vida por tanto el perro es un ser vivo.

El segundo equipo que paso dio sus explicaciones del porque ellos creían que la roca estaba viva su explicación fue que la roca estaba hecha de Silicio y Minerales y que esos elementos estaban vivos en el medio ambiente pero luego el maestro nos explico porque una roca no estaba viva nos explico que una roca si tiene los elementos pero esos elementos en ella no llevan a cabo ninguna función, que no tiene un metabolismo ni una respuesta al ambiente por tanto la roca no es un ser vivo.

El ultimo equipo nos explico acerca del virus, nos explico que un virus esta compuesto solamente de proteína y su cadena de ADN y que el por si solo no puede llevas acabo una función necesita de un huésped para lograr activarse. La respuesta del equipo fue que el virus no esta vivo.

Una vez terminada la actividad el maestro nos explico como una ser vivo esta formado biológicamente, que un ser vivo tiene células que llevan a cabo funciones para mantenernos con vida. Tiene un metabolismo que le permite llevar a cabo procesos para mantener la vida de la célula y que la célula lleven a cabo sus funciones correctamente. También una característica de los seres vivos es el crecimiento cosa que por ejemplo los virus no tienen.

Luego para finalizar nos explico la características químicas de los seres vivos. Todos los seres vivos estamos compuestos por moléculas que se clasifican en 4 tipos: los carbohidratos, las proteínas, los ácidos grasos y los lípidos.

El principal elemento del que esta formado todo ser viviente es el Carbono. También esta formado por otros como el H, O, N, S, P, K, Mg, Fe, entre otros.

Una pregunta que hizo una compañera que ¿Por qué el carbono se encontraba en casi todo? La explicación a esto fue que el Carbono es un elemento que puede formar enlaces mas fácil que otro elemento y que puede girar para formar larguísimas cadenas solo usando Hidrogeno para llenar espacios.

Al final se nos encargo estudiar la isomería.

Diana Nava

Martes 2 de febrero del 2010

Este fue nuestro primer día de la materia de bioquímica, el maestro se llama Ariel Rodrigo Villaseñor García, es biólogo y ha sido maestro de preparatoria. Al principio no se enfoco mucho en la presentación de los alumnos si no en las notas importantes, evaluaciones, y tareas de la materia que nos ayudaran en el transcurso de la materia. Nos explico lo de las evaluaciones, y los resúmenes de cada clase que tenemos que mandar al correo ariel.uvm@gmail.com, y como el designara el mejor resumen y lo publicara en el http://prepauvm.blogspot.com que nos ayudara a estudiar y ver los mejores apuntes de cada clase por si algún día faltamos, o queremos aclarar alguna duda.

En la hoja de evaluación habla sobre lo teórico, que tendrá el 80% de nuestra calificación y lo practico solo el 20%. Sobre las tareas es muy importante tener en cuenta que son por vía electrónica a su correo y que la fecha límite de entrega de las mismas es un día antes de la siguiente sesión a las 11:59 p.m, cumpliendo claro con el formato indicado. El plagio es motivo de anulación de la tarea, por lo que tenemos que tener mucho cuidado de no copiar a nuestros compañeros o algún texto previo de internet; de igual tenemos que ponerle bibliografía a todas nuestras tareas.

Para aprobar la materia se ocupa un mínimo de 6 en evaluaciones parciales y contar con el 80% de asistencia, poder exentar ordinario aun esta en duda. =)

Delia Hinojosa